All’interno della Basilica di Santo Spirito sono custodite alcune delle più importanti opere dei maestri rinascimentali, tra le quali il Crocifisso Ligneo di Michelangelo
Il complesso di Santo Spirito accoglie straordinari maestri: Filippino Lippi, Andrea Sansovino, Alessandro Allori, Bernardino Poccetti, Michelangelo, che qui trovò accoglienza dopo la morte di Lorenzo il Magnifico ed ebbe modo di studiare anatomia nello spedale del Convento, grazie al priore Niccolò di Lapo Bichiellini e che qui lasciò il giovanile Crocifisso, giovanile, dolcissima, e potente opera. Ed ancora, Bernardo Rossellino, Cosimo Roselli, Francesco Granacci, Michele e Ridolfo Ghirlandaio, Maso di Banco. La vetrata presente sulla facciata è invece stata realizzata su disegno del Perugino.